Не уверен, что вы подразумеваете под order by 5,6
, я предполагаю, что у вас есть столбцы с таким именем ...
В любом случае, это должно работать так:
results = MyModelForTable1.objects.values('u', 'v', 'x', 'y', 'z').annotate(Count('u')).order_by('5', '6')