Да, вы все равно должны минимизировать код JS. Это не поможет с задержкой в сети, поскольку файлы загружаются локально, но минимизированный код быстрее обрабатывается механизмом JavaScript браузеров. Чем быстрее анализируется JS, тем быстрее пользователи получают доступ к приложению.
Я бы порекомендовал подождать, чтобы минимизировать JS до последнего шага перед выпуском вашего приложения, потому что очень сложно отлаживать минимизированный код.