Используйте задачу exec следующим образом:
<exec executable="cmd" spawn="true">
<arg value="/c"/>
<arg value="foobar.cmd"/>
</exec>
Этого должно быть достаточно, в противном случае, если вам нужно использовать start / B ...:
<exec executable="cmd">
<arg value="/c"/>
<arg value="start"/>
<arg value="/b">
<arg value="foobar.cmd"/>
</exec>
Подробнее см. ant exec task .