Разница в том, что сопоставленные пакеты устарели. Вы должны использовать с 0.20.x новый материал внутри пакета mapreduce.
Например, новый способ реализации mapper, с mapred-package, вы должны реализовать интерфейс mapper. С помощью пакета mapreduce вы просто выходите из базового класса mapper и переопределяете только нужный вам метод.