Я не знаю, как использовать команду plotfile, но на графике 'just' я использовал такие маркеры, как
matplotlib.pyplot.plot(X1, Y1, 'go', X2, Y2, 'b-')
, где 'go' означает зеленые круги для первых графиков, 'b- 'означает синие линии для второго графика,' r-- 'означает красные пунктирные линии и т. д. *
Ознакомьтесь с документацией matplotlib.pyplot.plot
.