Я думаю, вы могли бы разумно пойти в любую сторону.Вы можете назвать файлы журналов в общем каталоге времени выполнения, чтобы идентифицировать приложение.Или, я полагаю, вы могли бы даже сделать так, чтобы они все записывали в один и тот же файл журнала, если вы переопределяете CLogRoute :: formatLogMessage (), чтобы он определял приложение в каждом сообщении журнала.
Так что мой ответ: что бы вы ни думали,быть более удобным на практике.
Кстати: макет, который использует yiiframework.com, необычайно сложен.Это отличная статья для изучения, но не обязательно подходящая структура dir прототипа.