Вы можете получить строку user-agent для текущей версии WebKit, используя JavaScript. Просто сделайте что-то вроде этого:
NSString* userAgent = [webView stringByEvaluatingJavaScriptFromString:@"navigator.userAgent"];
, который будет производить что-то вроде этого:
Mozilla/5.0 (Macintosh; Intel Mac OS X 10_7_2) AppleWebKit/534.51.14 (KHTML, like Gecko)
Затем можно проанализировать строку агента пользователя, чтобы получить используемую версию WebKit.