Вы можете получить папку с документами приложения
NSArray *paths = NSSearchPathForDirectoriesInDomains(NSDocumentDirectory, NSUserDomainMask, YES);
NSString *documentsDirectory = [paths objectAtIndex:0]; // Get documents folder
Вы можете создавать папки и файлы, используя NSFileManger. Вы можете хранить файлы в папке с документами или даже во временной папке.