Я недавно столкнулся с этой проблемой на Xcode 4.4.1, со старым iPod 3G под iOS 4.2.1.
Моему приложению требуется iMessage, поэтому я добавил запись UIRequiredDeviceCapabilities 'sms' в app-Info.plist.
Я обновил код своего приложения, чтобы проверить устройство на функциональность класса SMS (MFMessageComposeViewController) перед его выполнением, и удалил ключ 'sms'. Поэтому, когда я тестировал мой код на старых устройствах, чтобы увидеть, работает ли он, я однажды наткнулся на эту ошибку, когда заново добавил ключ sms 'app-Info.plist.
Теперь получите следующее: С моим приложением на старом устройстве (без ключа 'sms') я могу добавить или удалить ключ 'sms', и у Xcode нет проблем с очисткой / сборкой / запуском; но если я удаляю приложение с устройства и затем очищаю / собираю / запускаю, XCode жалуется на то, что каталог не существует (и он на самом деле существует), пока я не удалю досадный ключ sms.
Надеюсь, это имеет смысл и может кому-нибудь помочь.