Я думаю, что это просто относится к развертыванию с разнесенными типами .war.Например, tomcat автоматически взорвется (распакует) ваш военный файл, когда вы его развернете.AFAIU этот жаргон "конфигурации в разобранном виде" появился из-за опции в сервере приложений Jboss.[1]
AFAIR, когда речь идет о axis2, не существует специальной конфигурации, называемой разнесенным conf (я говорю о таких вещах, как axis2.xml / etc)
[1] http://community.jboss.org/wiki/ExplodedDeployment
HTH