Да, вы можете, но вам нужно будет обернуть javascript в раздел CDATA.Пример
<svg>
<script>
<![CDATA[
function()
{
any code........
}
]]>
</script>
</svg>
CDATA (неразобранные символьные данные) требуется в этом случае, потому что символы <и & javascript недопустимы в XML.</p>
Анализатор XML игнорирует все, что находится внутри секции CDATA.