Ну, одну простую вещь, которую вы можете попробовать, это удалить файлы из вашего локального репозитория, зафиксировать и отправить.Это означает, что файлы исчезнут и будут присутствовать только при предыдущем коммите.
Вероятно, это самый простой подход.Если вы хотите, чтобы ваши файлы также исчезли из всего веб-хранилища, то все становится сложнее.