На самом деле, @JK, wampmanager.tpl - это файл шаблона, используемый (wampmanager.exe при запуске) для генерации wampmanager.ini.Таким образом, вам нужно только отредактировать файл .tpl, и это решит его.
* СОВЕТ: Вы также можете добавить пользовательские меню к значку вашего wamp-лотка, добавив записи в файл wampmanager.tpl.