Если ваш вопрос «Как я могу предотвратить запуск phpPgAdmin», то не позволяйте веб-серверу справиться с этим. :) Просто удалите его из-под рута.
Если ваш вопрос «Как изменить порт, который я использую для входа в phpPgAdmin», это полностью зависит от конфигурации веб-сервера; вы устанавливаете его для прослушивания на другом порту.