Вы пытались добавить изображение {d100} span? На основании документации, это должно работать:
$('#glowingLayout').countdown({until: liftoffTime, compact: true,
layout: '<span class="image{d100}"></span>' +
'<span class="image{d10}"></span><span class="image{d1}"></span>' +
'<span class="imageDay"></span><span class="imageSpace"></span>' +
'<span class="image{h10}"></span><span class="image{h1}"></span>' +
'<span class="imageSep"></span>' +
'<span class="image{m10}"></span><span class="image{m1}"></span>' +
'<span class="imageSep"></span>' +
'<span class="image{s10}"></span><span class="image{s1}"></span>'});