Этот трюк работает для меня.
UIWebView *webView;
int scrollPosition = [[webView stringByEvaluatingJavaScriptFromString:@"window.pageYOffset"] intValue];
Пожалуйста, обратитесь к ответу Zamber для лучшего решения на iOS 5 и более поздних версиях. Мой ответ был для iOS 4 и ниже.