Не уверен, что вы подразумеваете под "как есть", но ответ - да, вы можете использовать AJAX в пользовательских элементах управления.
Обычная практика в отношении пользовательских элементов управления все еще применяется - использование ScriptManager
для управления экземплярами JavaScript на странице, правильное использование ViewState и т. Д.
Ваш вопрос довольно расплывчатый, поэтому довольно расплывчатый ответ.