Не могли бы вы дать более подробную информацию? если вы хотите контролировать и взаимодействовать с элементом управления WebBrowser в окне Internet Explorer, то вы можете сделать это. Код останется прежним, за исключением того, что вам потребуется изменить ссылку на MSHTML DOM при объявлении вашего (скажем) документа HTML, и он будет объявлен как тип InternetExplorer (появляется в intellisense после части «Как», если вы использую VB, та же история с c #).
Как только вы обращаетесь к этому окну, вы можете управлять им - все то же самое, так как IE также использует элемент управления WB, если вы хотите использовать элемент управления WB в своем приложении, у вас должна быть возможность дать нам еще немного детали, вы говорите, что контент или ссылки открываются в новом внешнем окне IE? Если это так, эти вещи можно исправить:).
Кроме того, если вы используете WPF .NET, я думаю, что для этого есть другой, менее крутой элемент управления WB, чем традиционный .NET WB. Пожалуйста, уточните свой вопрос, чтобы я мог помочь вам в дальнейшем.