О, конечно, вы можете. Вы можете явно позвонить аппендиру по имени .
Итак, если у вас есть аппендер, как
log4j.logger.MyLog=DEBUG, mylog
#additivity false, means just don't append to default root logger as well
log4j.additivity.MyLog=false
#other usual props
log4j.appender.mylog=org.apache.log4j.RollingFileAppender
log4j.appender.mylog.maxFileSize=5000KB
log4j.appender.mylog.maxBackupIndex=3
Теперь, в вашем классе, используйте этот appender как
Logger log = Logger.getLogger("MyLog");
Вы сделали.