Добавьте исходный файл (только файл, а не папку .lproj), затем сделайте его локализуемым, добавьте все языки, которые вам нужны, xcode создаст папки .lproj и продублирует ваш исходный файл для каждого языка.
После того, как вы сможете перезаписать каждый файл, дублированный уже переведенным файлом (либо файлом, если он имеет то же имя, либо содержимым).
Не забудьте установить формат исходного файла UTF-16 при его добавлении.