Команды ImageMagick mogrify / convert действительно сделают эту работу. У Стивена Пейджа была почти правильная идея, но вам также нужно установить dpi файла, иначе вы не сможете выполнить работу.
Если у вас есть файл с разрешением 300 точек на дюйм и соотношением сторон, равным 8,5 x 11, команда будет выглядеть так:
// 300dpi x 8.5 -2550, 300dpi x 11 -3300
convert original.pdf -density "300" -resize "2550x3300" resized.pdf
Если соотношение сторон другое, вам нужно сделать немного более сложную обрезку.