Файлы для баз данных MySQL MyISAM можно скопировать, но вам нужно изменить разрешения и выполнить некоторые другие задачи, чтобы заставить его работать с новым именем. Обычно проще просто вывести базу данных в файл и повторно импортировать ее.
Самый простой способ сделать это, если вы не возражаете против используемой вами базы данных, - это использовать что-то вроде гиперзвуковой базы данных на основе Java. Это действительно легко скопировать и работать с новыми версиями.