Я использовал оба, и обнаружил, что Jetty намного проще в установке на CentOS. Тем не менее, у меня есть один сервер, работающий с Tomcat, и он отлично работает (на 512 МБ Linode).
Я видел незначительное улучшение производительности на Jetty для большого поискового сервера, но ничто не заставило бы меня выбрать его вместо Tomcat только по соображениям производительности ...