Пожалуйста, посмотрите на мой ответ здесь: Git и жесткие ссылки
Я пытался вставить такой же скрипт в pre-commit, но как-то жесткие ссылкине создается.
Сценарий действительно выполняется (т. е. echo внутри него подтверждает это).
Я попытался запустить тот же ln вручную в корневой папке хранилища и той же командойработает так.
Спасибо за внимание.