Я не знаю, как выглядит ваш конкретный стек, но если вы используете что-то вроде Spring / Hibernate, я использовал эту небольшую библиотеку шаблонов для создания (и уничтожения) куч тестовых данных для запуска через тип интеграции JUnit тесты очень легко:
http://code.google.com/p/make-it-easy/
Существует также DBUnit http://www.dbunit.org/, который может делать то, что вы хотите, но у меня был меньший успех в тех приложениях, над которыми я работал. Однако это может быть просто билет для ваших нужд.