Можете ли вы, до и после сохранения, сделать
:verbose set filetype
:verbose set
Совет: используйте :redir > file.txt
для захвата вывода, чтобы вам не пришлось копировать / вставлять какиеможет быть сложно с gvim - для вывода команды
Вы также можете посмотреть автокоманды при сохранении:
:verbose au BufWrite
:verbose au BufWritePre
:verbose au BufWritePost
Это поможет выяснить, какой плагин / скрипт вызывает выделениесойти с ума.