Вы можете поместить CSS либо в строку, либо в таблицу стилей.
<iframe src="http://path.to/content" style="width: 200px; height: 100px;
position: absolute; top: 0; left: 0; z-index: 100000;" id="overlay_frame"></iframe>
Затем, для вашей ссылки "закрыть", у вас есть выбор: либо полностью уничтожить iframe:
<a href="#" onClick="document.getElementById('overlay_frame').removeChild(
document.getElementById('overlay_frame').childNodes[0] );">Close</a>
или просто скрывая это:
<a href="#" onClick="document.getElementById('overlay_frame').style.display='none';">Close</a>
Лично я бы просто спрятал его, чтобы вы могли снова использовать его, изменив источник:
<a href="#" onClick="document.getElementById('overlay_frame').src='http://link.to/something/else';">Change Frame</a>