Вы можете использовать атрибут runat="server"
для него и предоставить ему идентификатор:
<fieldset>
<legend runat="server" id="leg">Some Legend</legend>
Some value
</fieldset>
, а затем в коде позади используйте идентификатор, чтобы скрыть его:
protected void Page_Load(object sender, EventArgs e)
{
leg.Visible = false;
}