Правильный ответ - в настройках «Пакет / публикация в Интернете» (в свойствах проекта веб-приложения) найти «Элементы для развертывания».
Для веб-приложения вы бы хотели, чтобы «Элементы для развертывания» имели «Только файлы, необходимые для запуска этого приложения», которые НЕ будут копировать файлы исходного кода, поскольку они были скомпилированы в DLL в папке bin.
Обратите внимание, что этот параметр зависит от вашего текущего типа сборки (Debug / Release / etc), поэтому планируйте соответственно ...
Ciao!