Ну, у вас должно быть 2 объекта uipicker в вашем классе в качестве переменных экземпляра.
В источниках данных uipicker и методах делегатов вы можете проверить, для какого средства выбора эти методы вызываются, и затем загрузить в них данные соответственно.
Но если у вас нет IBOutlet для uipicker (если вы создали их в xib), просто используйте теги, чтобы идентифицировать сборщик и загрузить данные соответствующим образом.