Это происходило и со мной.
В моем случае это был параметр фильтрации xss в CodeIngniter, который я использую в качестве фреймворка PHP. То, как CKEditor публикует атрибуты изображения по какой-то причине, отфильтровывается.
В случае, если вы используете CodeIgniter, это было исправлением для меня
В /application/config/config.php
Изменение
$config['global_xss_filtering'] = true;
до
$config['global_xss_filtering'] = false;
.. и, конечно, убедитесь, что вы не используете xss_filtering в правилах form_validation вашего контроллера.