Я понятия не имею, почему python запускает каждый скрипт в новом командном окне.
Например, я запускаю: python testfile.py
, оно показывает новое окно и сразу закрывается, поэтому я не могу посмотреть трассировку.
Python 2.7 32-битный на той же машине работает нормально