Если они могут изменить javascript, то они могут удалить любую контрольную сумму или что-либо подобное, что вы вставили. Лучше всего вам использовать javascript obfuscator / minimizer, так как это просто усложнит изменение и все еще работает,У Yahoo есть хороший пример, как и у Google.
Это не защищает от дурака, но, вероятно, собирается отсеять почти всех, учитывая возможность подделки вашего апплета.Зайдите на maps.google.com и посмотрите на их JavaScript.Подумайте о хитрой модификации чего-либо об этом.Вероятно, не произойдет.
РЕДАКТИРОВАТЬ: это может быть не так хорошо, в конце концов, см. Ссылки ниже