Если вы не переопределили onPause, как насчет onResume, onStart, onStop или onRestart?
Из того, что вы сказали, наиболее вероятная проблема - на Resume. Вы что-то переопределяете в базовых классах своей деятельности?
Я предполагаю, что вы пытаетесь отобразить какой-то диалог отладки, и он запускается в onResume.
Кроме того, вы пытаетесь что-нибудь сделать со стилями?