Вы хотите использовать двойные кавычки или вы хотите избежать имени?Если вы просто хотите уйти, используйте backticks (`), и Hibernate преобразует его в любой механизм, используемый вашей базой данных для выхода.Итак, ваш пример будет:
@Column(name="`SERIAL#`")
Просто из любопытства: зачем вам знак # в имени столбца?Я всегда думал, что специальные символы плохая идея в идентификаторах: -)