Как сказал @Mike, я почти готов поспорить, что проблема в том, что путь к файлу CSS отличается, когда вы запускаете локально, чем при запуске на сервере.
Где находятся ваши CSS-файлы?
Например, если вашей корневой папкой IIS является c: \ inetpub \ wwwroot ... ваши CSS-файлы находятся под
- c: \ inetpub \ wwwroot \ somefolder \ content \ style.css или ниже
- c: \ inetpub \ wwwroot \ content \ style.css