Я должен догадаться, как вы обрабатываете свою SMS-рассылку, но я думаю, что вы вызываете abortBroadcast (); после того как вы получили смс.
В противном случае широковещательная рассылка будет перенаправлена следующему получателю, например, в приложение «sms».
Если вы прервете широковещательную рассылку с более высоким приоритетом получателя, ваше приложение прервет входящие смс, и приложение стандартных смс не сможет сохранить их в истории.
Надеюсь, это поможет вам.