Я закончил тем, что отказался от плагина Paste в TinyMCE.Вместо этого я использовал недокументированное свойство valid_styles TinyMCE.Это решило проблему отлично для моего сценария.Вот фрагмент конфигурации, который мы использовали в итоге:
valid_elements: "a[href|title|target],del,b,strong,del,i,blockquote,p,br,em,ul,li,ol,span[style]",
valid_styles : { '*' : 'font-weight,font-style,text-decoration' },