«Проблема» в том, что вы установили matplotlib, или, точнее, в две его установки, а не в программу, которую вы пытаетесь запустить.
Из сообщения я могу сделать вывод, что у вас естьодна версия matplotlib, установленная в / usr / local - возможно, более новая версия, которую вы установили самостоятельно, не используя управление пакетами ОС?- и другая версия в стандартном расположении ОС, /usr/lib/pymodules/python2.6.
В предупреждающем сообщении говорится, что Python заметил упакованную версию ОС, но она собираетсяигнорировать его (т. е. не загружать из него какие-либо модули), потому что он уже нашел версию в / usr / local и не может иметь смысла иметь модули из двух разных каталогов.
Если вы хотели иметь две версии и хотели использовать версию в / usr / local, то предупреждение для вас практически безвредно.
Если вы не знали, что у вас установлены две версии matplotlibВы можете попытаться немного исправить эту ситуацию.