Это кажется глупым дизайном базы данных, и это вызовет у вас больше проблем, чем просто это. Если все данные одинаковы, то они должны быть в одной таблице. Разделяете ли вы физическое хранилище этой единственной таблицы, это проблема реализации низкого уровня, а не то, что должно отображаться в схеме.
Я даже не знаю, как вы скажете EF, что вы добавили новую таблицу, и вы должны относиться к ней, как к другим. Это не имеет особого смысла.