Нет крюка предварительного толкания.
И даже если бы они были, я очень сомневаюсь, что вы захотите сгенерировать и зафиксировать огромное количество HTML.
Однако, возможно, вы захотите вызвать что-то из ловушки после обновления репозитория, в который вы добавили. Он может обновить не обнаженный клон и запустить в нем doxygen, оставив результаты где-то в открытом доступе.