Наконец-то разобрался. Когда я добавил директиву DirectoryIndex, я добавил ее к основному виртуальному хосту httpd.conf, который я только что создал, пока второй сервер все еще работал на втором экземпляре. Теперь я чувствую себя глупо!
Для всех, кто читает, если вы получаете эту ошибку и не можете понять, почему, вам нужно добавить директиву DirectoryIndex.