Navicat для SQLite может сделать это (версия Enterprise является единственной версией, которая поддерживает это, через http://www.navicat.com/en/products/navicat_sqlite/sqlite_feature.html)
У него есть инструмент для моделирования, но чтобы его использовать, мне понадобилось немного, чтобы понять интерфейс:
Установите соединение с вашей базой данных.
Дважды щелкните по соединению. Щелкните правой кнопкой мыши по основному (обычно это база данных) и выберите в меню «Обратное преобразование базы данных в модель ...».
Открытие инструмента «Модель» напрямую и попытка сделать это кажется невозможным.
Я не работаю на них .. Я купил его в продаже где-то за 25 долларов.