Оценка выражений, вызываемых из Java в R. Ошибка нехватки памяти: куча Java - PullRequest
Новая
       29

Оценка выражений, вызываемых из Java в R. Ошибка нехватки памяти: куча Java

1 голос
/ 07 ноября 2011

У меня проблема с загрузкой большого набора данных в R из Java.Проблема на самом деле с функцией, которую я использую: re.eval().Я хочу загрузить файл в R, чтобы я мог анализировать / манипулировать им в R, однако я хочу сделать это из Java (это для того, чтобы построить GUI).

Я хочу, чтобы функция выполняла синтаксический анализ и оценку предоставленной мною строки, однако функция eval анализирует, оценивает и возвращает результат.Я получаю ошибку нехватки памяти от Java относительно размера кучи.Это код, который у меня есть на данный момент: 

JButton getFile = new JButton("Load");
        getFile.setBounds(316, 10, 151, 23);
        getFile.addActionListener(new ActionListener() 
        {
            public void actionPerformed(ActionEvent e) 
            {
                    REXP x;
                    getFileName();
                if (dataFilePath != null){
                String file = dataFilePath.replace("\\", "\\\\\\\\");
                re.eval("data<-read.csv(file='"+file+"', head=TRUE, sep='|')");


                x = re.eval("names(data)");

                String[] column_names = x.asStringArray();
                originalDataLength = column_names.length;

                for (int i = 0; i < column_names.length; i++) {
                        comboBox.insertItemAt(column_names[i], 0);  
                    }

                textField.setText("Data Loaded");
                }

        }
    }
);

Этот код работал, когда я работал с кадром данных, который был 13500x220.Новый фрейм данных - 50000x700.Мне также было интересно, что именно происходит в коде выше?Он создан в R и отправлен обратно в Java (т.е. дублирован?).

Любая помощь / комментарии будут с благодарностью.Также я посмотрел описание класса Rosuda Rengine и доступные функции;Я думал, что, возможно, rniEval() может решить проблему, но я не знаю, как это реализовать.

1 Ответ

0 голосов
/ 07 ноября 2011

actionPerformed вызывается в стеке событий, и вы должны держать обработку событий короткой. Это может помочь . Звоните: 

SwingUtilities.invokeLater(new Runnable() {
    public void run() { ... your code ... }
}

Кроме того, нужно объединить оба выражения eval в R, если нужны только имена столбцов. Может быть, просто прочитать первую строку (по Java?).

...