Кажется, вы ссылаетесь на код, сгенерированный для выполнения хранимой процедуры. Этот метод в сгенерированном классе контекста создается заново каждый раз, когда вы сохраняете модель домена (файл .rlinq). Если вы хотите изменить тип возвращаемого значения, вы можете создать частичный класс для контекста и добавить туда метод.
По поводу вопроса - как изменить тип возвращаемого значения сгенерированного метода? В настоящее время это не поддерживается дизайнером, но работа над подробным пользовательским интерфейсом для хранимых процедур продолжается. Следующий пакет обновления, скорее всего, будет иметь пользовательский интерфейс, в котором вы можете выбрать существующий постоянный тип в качестве возвращаемого значения или вы можете сгенерировать тип CLR, который сопоставляется с возвращаемым результатом.