Я могу только предложить поместить пустое (по умолчанию) значение в установщик, оставив его пустым, что приведет к нулевому результату, иначе можно удалить атрибут nil:
xnode.RemoveAttribute("nil", "http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance");
где xnodeэто узел с нулевым значением.
надеюсь, что поможет