Для этого вам понадобится несколько приложений heroku - если это действительно то, что вы хотите.
Однако, если у вас есть myapp.heroku.com, вы можете добавить подстановочный знак настраиваемого домена водно приложение, которое заставит ваше приложение прослушивать * .mydomain.com - так что, что угодно.mydomain.com будет проходить к вашему приложению, где вы сможете использовать его в своем коде.