Да, Emacs поддерживает cscope, есть несколько вариантов:
http://www.emacswiki.org/emacs/CScopeAndEmacs
Я только что протестировал xcscope.el в GNU Emacs 24, и, похоже, он работает нормально.
Если у вас уже есть база данных cscope, я предлагаю запустить cscope из командной строки, используя флаг -d:
cscope -d
Используйте опцию «Найти это глобальное определение» для поиска вашего символа. Если вы не получили никаких результатов, проблема связана с cscope, а не с Emacs. Если вы нашли результаты, пожалуйста, предоставьте более подробную информацию, например, какой метод интеграции cscope с Emacs вы используете, какая версия Emacs и пример кода perl, который можно использовать для воспроизведения проблемы.
Вы также можете исследовать cedet:
http://cedet.sourceforge.net/