Извлеките исходный код php из svn или загрузите исходный код dist на php.net и соберите его, используя руководство Лучше сделать это на системах nix или скомпилировать PHP с помощью cygwin на Win . Вы можете легко настроить расширения php при его создании и исключить некоторые из них, используя скрипт configure. Если вам нужны более конкретные конфигурации, вы должны знать, как работает Autotools, так как php использует его.