Если вы уже использовали Git на beanstalk, вы можете просто создать пустой репозиторий на GitHub и затем добавить его в качестве удаленного в локальный репозиторий.
(при условии, что ваш репо находится в ~ / project)
cd ~/project
git remote add github <github-ssh-url-here>
git push github --all --tags